До складу інституту входять:
Кафедри
- ДВЗУ та ТЕ (Двигуни внутрішнього згорання, установки та технічна експлуатація);
- ЕСЕУ та ТЕ (експлуатації суднових енергетичних установок та теплоенергетики);
- ІМ та ТМ (інженерної механіки та технології машинобудування);
- К і Р (кондиціювання та рефрижерації)
- ТТ і СПУ (технічної теплофізики і суднових паровиробних установок)
- Турбін
Центри
ННЦМІ (Навчально-науковий центр морської інфраструктури)
з підрозділом ЦПДвЕ (Центр прикладних досліджень в енергетиці)