Кафедри МННІ проводять активну роботу з організації наукових конференцій. Так, міжнародні конференції:

• «Суднова енергетика: стан та проблеми»
• «Актуальні проблеми інженерної механіки»
• «Сучасний стан та проблеми двигунобудування»
• «Холод в енергетиці, промисловості»

входять у плани Міністерства освіти і науки України. Одним із пріоритетних напрямків наукової роботи НДІ ЕМ є участь у міжнародних наукових проектах.